Однією з головних екологічних проблем Запорізької області залишається забруднення атмосферного повітря. Незважаючи на те, що екологічна ситуація залишається складною, останнім часом спостерігаються тенденції до її стабілізації. Орієнтовні дані стосовно викидів забруднюючих речовин в атмосферне повітря від стаціонарних джерел за І півріччя 2009 року становлять 82,6 тис. т, що на 30,8 тис. т (або на 27,5 %) менше, ніж у І півріччі 2008 року. 

Також гострою екологічною проблемою регіону залишається забруднення поверхневих водних неочищеними і недостатньо очищеними зворотними водами промислових підприємств металургійного комплексу, підприємств житлово-комунальної галузі, а також виправних колоній Управління державного департаменту України з питань виконання покарань в Запорізькій області. Особливу увагу учасниками колегії було приділено стану реалізації повноважень Державного управління у галузі регулювання використання, охорони та відтворення водних ресурсів у І півріччі 2009 року. 

Обсяг скидання зворотних вод в басейн Дніпра складає близько 98% загального водовідведення по області, тому пріоритетним є виконання заходів, передбачених Національною програмою екологічного оздоровлення басейну Дніпра та поліпшення якості питної води.  

Першочерговим для області залишається завершення заходів по припиненню скидів через об’ємний шламонакопичувач ВАТ «Запоріжсталь», а також виконання у повному обсязі заходу «Розширення та реконструкція ЦОС-1 м.Запоріжжя. Другий пусковий комплекс (станція зневоднення осаду)», на що у 2009 році передбачені кошти міського екофонду Запоріжжя в сумі 8 млн.грн.

Завдяки введенню в експлуатацію в липні 2008 року першого пускового комплексу об’єкту «Розширення та реконструкція центральних очисних споруд Лівого берега (ЦОС-1) м. Запоріжжя», практично вирішена головна екологічна проблема, що мала місце впродовж багатьох років - забруднення р. Дніпро неочищеними і недостатньо очищеними стічними водами КП «Водоканал». Каналізаційні стічні води цієї частини міста в повному обсязі близько 150 - 170 тис. м3/добу проходять біологічну очистку. Вміст забруднюючих речовин у зворотних водах після очищення скоротився: по зважених речовинах – в 6 разів, по азоту амонійному - в 10 разів, по біологічному споживанню кисню (БСК5) – більше, ніж в 5 разів.

Екологічна ефективність даного водоохоронного заходу має особливе значення для цілого регіону півдня України тому, що нижче по течії з Каховського водосховища здійснюється забір води на питне водопостачання населення Автономної Республіки Крим, півдня Запорізької області, Криворіжжя та окремих районів Кіровоградської області.